¿Cuándo nació cada gen de Arabidopsis?

27 420 genes nucleares, cada uno con la edad de su familia: desde hace 4 400 millones de años hasta hoy.

Cómo leer esto

Para cada gen codificante nuclear de Arabidopsis thaliana estimamos cuándo apareció su familia, a partir de los árboles de genes de Ensembl Compara. La técnica se llama filostratigrafía.

Qué ves

Cinco bandas: los cromosomas 1–5, a escala. Cada carácter agrupa genes vecinos; se vuelve más denso a medida que nacen sus familias.
Color: edad del estrato, de púrpura (antiguo) a verde claro (reciente). Las bases A T G C marcan nacimientos recientes.
El eje tiene cortes (//): los períodos sin ningún estrato se comprimen y se cruzan rápido. Dentro de cada tramo el tiempo va en raíz cuadrada, que comprime lo muy antiguo. Las distancias entre tramos no están a escala; las fechas de cada corte están rotuladas.
Dentro de un estrato, el orden de aparición es aleatorio y no significa nada.
Sonido: cada estrato tiene su propio acorde de fondo; las campanas marcan nacimientos, más agudas cuanto más reciente la familia.

Qué no hay que sobreinterpretar

La edad es la de la familia génica, no la del gen concreto, y es una cota mínima. Depende de las especies que Ensembl muestrea y de cómo agrupa.
«Procariotas / LUCA» incluye familias que llegaron con el cloroplasto o la mitocondria mucho más tarde.
«Sin homólogos» no significa origen de novo: puede ser un gen muy divergente o no agrupable.
Las fechas son rangos de 1–2 estudios por nodo. Eukaryota aparece como 1,67–1,80 Ga, pero la literatura abarca 0,95–2,39 Ga.
Quedan fuera los 208 genes de cloroplasto y mitocondria.

Estratos

Datos: Ensembl Compara (rest.ensembl.org), árboles pan-taxonómicos y de plantas; anotación Araport11 sobre TAIR10. Fechas: fuentes por estrato en la tabla.